Finalmente fiz o programa que reune a aquisição de dados do arduino e do Daq9188 pelo labview. disponibilizo ele e as imagens sem e com o peltier ligado, que usei para teste.

Vesão 2: Esta é a versão mais atual do programa, a diferença dela pra outra, é que o arduino nao faz mais duas leituras, ele faz apenas uma leitura de tudo ao mesmo tempo,

é o LabView que se preocupa em dividir o que é o que, isso tirou dois loops, aumentando velocidade e simplicidade do código dentre outras mudancas, alem de ter posto um sistema preliminar de alarmes.

Se tudo der certo criarei um sistema de segurança para evitar danos no peltier e um sistema para gerar um txt com os dados obtidos nas medidas. 

(Imagem1: Peltier desligado)

(Imagem 2: Peltier ligado 2V e 4V)